教會祈禱會逢星期三晚上八時正在芥菜種社會服務中心禮堂舉行 (不設 Zoom)，惟每月最後一個星期三則以 Zoom 進行（除特別調動的安排外）。

祈禱會由教牧同工及執事領袖輪流主領，為本會各項事工、病患肢體、宣教士及其工場代禱，誠邀會眾同心參與。